แม้ว่าผลิตภัณฑ์เยื่อขึ้นรูปจะมีข้อดีหลายประการ แต่ก็มีข้อจำกัดบางประการในการใช้งานเช่นกัน เยื่อกระดาษขึ้นรูปไม่แข็งแรงเท่ากับวัสดุแบบดั้งเดิม เช่น พลาสติกและโลหะ ซึ่งสามารถจำกัดการใช้งานในบางประเภทได้ นอกจากนี้ ผลิตภัณฑ์เยื่อขึ้นรูปอาจผลิตได้ในปริมาณมากได้ยากขึ้น ซึ่งอาจทำให้ต้นทุนการผลิตเพิ่มขึ้น
